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>vwinchina德赢>巨纳米机器帮助免疫系统:理论化学

Lars Sch�fer and his team use simulations to clarify the structure and dynamics of proteins. � RUB, Kramer
Lars Sch�fer and his team use simulations to clarify the structure and dynamics of proteins. � RUB, Kramer

抽象:
由病毒感染或携带致癌突变,例如细胞,产生异性的身体的蛋白质。从细胞内这些外源蛋白的降解导致的抗原肽由肽装复装载到所谓的主要组织相容性复合体分子(MHC的简称)和呈现在细胞表面上。在那里,它们是专门为T杀伤细胞,最终导致鉴定,以消除感染的细胞。这是我们的免疫系统如何捍卫我们免受病原体。

巨人纳米机器帮助免疫系统:理论化学

德国波鸿|发表于2020年8月28日

整机采用原子精度运行

将肽装载复杂确保了MHC分子正确地装载有抗原。"The peptide-loading complex is a biological nanomachine that has to work with atomic precision in order to efficiently protect us against pathogens that cause disease," says Professor Lars Sch�fer, Head of the Molecular Simulation research group at the Centre for Theoretical Chemistry at RUB.

在以前的研究中,其他小组成功地确定所述肽装复使用低温电子显微镜的结构,而只用一个分辨率约0.6至1.0纳米的,即不以原子细节。Based on these experimental data, Sch�fer's research team in collaboration with Professor Gunnar Schr�der from Forschungszentrum J�lich has now succeeded in creating an atomic structure of the peptide-loading complex.

探索结构和动力学

"The experimental structure is impressive. But only with our computer-based methods were we able to extract the maximum information content contained in the experimental data," explains Schr�der. The atomic model enabled the researchers to perform detailed molecular dynamics computer simulations of the peptide-loading complex and thus to study not only the structure but also the dynamics of the biological nanomachine.

由于模拟系统是它的160万个原子非常大的,在莱布尼茨超级计算中心在慕尼黑的计算时间大大帮助该任务。“使用高性能计算机,我们能够推到微秒的时间尺度在我们的模拟,这表明与蛋白结合的肽加载的机制,以前仅不完全了解,糖集团的作用”的轮廓奥利维尔Fisette博士,分子模拟研究小组博士后研究员。

在免疫过程的直接干预

肽装载复杂的原子模型现在有利于进一步研究。例如,一些病毒尝试通过有选择地切断肽装载复杂的某些元件欺骗我们的免疫系统。"One feasible objective we'd like to pursue is the targeted intervention in these processes," concludes Sch�fer.

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资金

这项研究是由德国研究基金会资助的优秀鲁尔探索溶剂化RESOLV(EXC 2033)的群集的一部分。

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欲了解更多信息,请点击这里

联系方式:
Lars Sch�fer

49-234-322-1582

@ruhrunibochum

版权©Ruhr-Universit�t Bochum

如果您有任何意见,请联系我们。

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